Μια γονιδιωματική έρευνα για τους μύκητες που ζουν στο δέρμα μας παρέχει ένα πλαίσιο για την κατανόηση του τρόπου με τον οποίο αυτά τα μικρόβια συμβάλλουν στην υγεία και την ασθένεια του δέρματος.
Σύνθετες κοινότητες μικροβίων ζουν στην επιφάνεια του σώματός μας. Αυτοί οι μύκητες, τα βακτήρια και οι ιοί είναι συλλογικά γνωστοί ως το μικρόβιο του δέρματος. Μια ομάδα από το Εθνικό Ινστιτούτο Έρευνας για το Ανθρώπινο Γονιδίωμα του NIH (NHGRI) και το Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου (NCI) χρησιμοποίησαν προηγουμένως γονιδιωματικές τεχνικές για τη μελέτη βακτηρίων του δέρματος. Βρήκαν ποικίλες βακτηριακές κοινότητες που διέφεραν μεταξύ των ανθρώπων και ανά περιοχή του δέρματος. Στη νέα τους μελέτη, η ομάδα χρησιμοποίησε μια παρόμοια γονιδιωματική προσέγγιση για να κατανοήσει καλύτερα τους μύκητες που ζουν στο δέρμα μας.
Οι μύκητες περιλαμβάνουν καλούπια, μανιτάρια και τη μαγιά που χρησιμοποιούνται για τη ζύμωση ψωμιού και μπύρας. Αυτά τα μικρόβια έχουν συσχετιστεί με πολλές δερματικές παθήσεις και καταστάσεις, συμπεριλαμβανομένων των ποδιών του αθλητή, του εκζέματος, της πιτυρίδας και των λοιμώξεων των νυχιών. Οι μυκητιασικές λοιμώξεις του δέρματος επηρεάζουν περίπου 29 εκατομμύρια ανθρώπους σε εθνικό επίπεδο. Αλλά οι μύκητες μπορεί να αργήσουν και να αναπτυχθούν δύσκολα σε εργαστήρια, καθιστώντας τους μυκητιάσεις δύσκολο να εντοπιστούν και να αντιμετωπιστούν.
στις 22 Μαΐου 2013, οι επιστήμονες συνέλεξαν δείγματα σε 14 σημεία του σώματος από 10 υγιείς ενήλικες. Επικεντρώθηκαν σε ένα θραύσμα του DNA που μοιράστηκε όλοι οι μύκητες - ο μεσολαβητικός εσωτερικός μεταγραφόμενος διαχωριστής 1 (ITS1) ριβοσωμικού RNA - που θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί για την ταξινόμηση των μυκήτων στο επίπεδο του γένους με ακρίβεια μεγαλύτερη από 97%.
Δημιουργώντας περισσότερες από 5 εκατομμύρια ακολουθίες ITS1 από τα δείγματα, η ομάδα μπόρεσε να εντοπίσει περισσότερους από 80 τύπους μυκήτων σε επίπεδο γένους που ζουν στο ανθρώπινο δέρμα. Αντίθετα, οι παραδοσιακές μέθοδοι καλλιέργειας μπορούσαν να εντοπίσουν μόνο 18 τύπους. βρέθηκαν σε όλα τα σημεία του δέρματος. ήταν ο κυρίαρχος τύπος σε 11 από τις 14 θέσεις, συμπεριλαμβανομένων πίσω από τα αυτιά, στα ρουθούνια, στην πλάτη και στους βραχίονες.
Η ομάδα διαπίστωσε ότι τα τακούνια, τα οποία δεν δείχνουν εκτεταμένη βακτηριακή ποικιλομορφία, ήταν η πιο περίπλοκη τοποθεσία για μύκητες, με περίπου 80 τύπους. Οι ιστοί toe, με περίπου 60 τύπους και τα νύχια, με 40, είχαν τα επόμενα υψηλότερα επίπεδα μυκητιασικής ποικιλομορφίας. Τα χέρια και τα χέρια, που φιλοξενούν μεγάλη ποικιλία βακτηρίων, είχαν σχετικά λίγους τύπους μυκήτων. Οι μυκητιακές κοινότητες στο σώμα του πυρήνα ήταν αρκετά σταθερές με την πάροδο του χρόνου, με μικρή αλλαγή όταν δοκιμάστηκαν έως και 3 μήνες. Αντίθετα, οι μύκητες στα πόδια άλλαξαν σημαντικά σε διάστημα 3 μηνών, αντικατοπτρίζοντας ίσως περισσότερη περιβαλλοντική έκθεση.
Οι μυκητιακές κοινότητες στο ανθρώπινο σώμα είναι περίπλοκες και συγκεκριμένες για την τοποθεσία », λέει ο συν-ανώτερος συγγραφέας Δρ Heidi Kong του NCI. Με την πληρέστερη επίγνωση των μυκητιακών και βακτηριακών οικοσυστημάτων, μπορούμε να αντιμετωπίσουμε καλύτερα τις σχετιζόμενες δερματικές παθήσεις, συμπεριλαμβανομένων των μυκητιασικών λοιμώξεων, οι οποίες μπορεί να σχετίζονται με θεραπείες καρκίνου.
Τα δεδομένα από τη μελέτη μας μας δίνουν μια βάση για τα φυσιολογικά άτομα που δεν είχαμε ποτέ πριν », λέει η συγγραφέας Δρ. Τζούλι Σέγκρε του NHGRI. Η ουσία είναι ότι τα πόδια σας είναι γεμάτα μυκητιακή ποικιλία, οπότε φορέστε τις σαγιονάρες σας στα αποδυτήρια αν δεν θέλετε να αναμίξετε τους μύκητες των ποδιών σας με μύκητες κάποιου άλλου.
